Здесь не самовольное строение. Здесь реконструкция многоквартирного дома (согласно письму Минэкономразвития РФ т 19 января 2010 года № Д23-99, две и более квартиры - это уже многоквартирный дом), изменение его общего имущества, еще и без согласия других собственников. Другие собственники могут быть против увеличения площади земельного участка под многоквартирным домом, который в соответствии с ЖК РФ является общим имуществом собственников, равно как и против изменения иного общего имущества (крыша, несущие конструкции).
Так что здесь речь о признании права на самовольную постройку не идет.
Можно конечно пробовать обжаловать, но результата это не принесет. Когда гражданин нарушал закон, малолетний ребенок его не остановил ведь...
Dura lex sed lex.