Насколько я знаю, выходные дни периода командировки в табеле принято обозначать как "В".
Почему для простоя должно быть иначе?
Если отмечать как "простой" (или "командировка") весь соответствующий период (включая нерабочие дни), то по табелю не определишь количество дней, которые надо оплатить.
Но если для бухгалтеров это не проблема, то и ладно.