При наличии "личной" ЭП наше отделение ФСС (и одно московское, куда я отчитываюсь за ИП с его ЭП) никогда не требовало никаких соглашений. Как уполномочка я предоставляю им копию доверенности. Но программа (СБИС) не даст мне подписать отчет, если в нем подписантом не будет выступать владелец ЭП, в данном случае я. А вот с отчетами в ПФ такого контроля в программу не встроено.
И за одно ООО отправляю отчеты под своей подписью-как электронной, так и с указанием меня в качестве подписанта. А соглашение с ПФ подписано директором, да.