Любое увеличение уставного фонда происходит по решению собственника, не зависимо от источника его формирования.Все изменения вносятся изменениями в устав и подлежат регистрации.
Сейчас инструкция по бюджетному учету требует отражение в учете подобных вложений.Считаю не верно , что то отражать выборочно, д.б. сопоставимость в учете ГУПа, МУПа, с данными ОИВ на который возложены полномочия учредителя.