Начальнику Вашему все равно - он из своего, так сказать, кармана будет платить Вам только зарплату за отработанное время, а выплаченное пособие по уходу предприятию вернет ФСС, которому точно необязательно знать где живет ребенок.
Зарплата так и будет расчитываться - пропорционально отработанному времени.