Если Вы на спецрежиме, то это обычная практика - не признает ФСС долги перед нами до тех пор, пока не проверит правильность расчетов и не возместит деньги.
За год делаете обычную 4-ФСС (без расходов), потом подготовите промежуточную, соберете документы на возмещение. Когда из ФСС придут деньги, тогда и отразите расходы и возмещение.