Два варианта:
1. Если данные в 3-НДФЛ не сойдутся с данными по отчётам 2-НДФЛ (от налоговых агентов), то Вас обвинят в сокрытии и т.д. и т.п. Что будет - зависит от размера сокрытого (от штрафа до уголовного дела).
2. Если 2-НДФЛ сдавались по разным регионам, то могут не обнаружить ничего, т.к. обмен информацией между региональными УФНС толком не отлажен. И я пока не слышал о сводной базе по НДФЛ за 2007 год, поговаривали только о 2005 годе.