Съездил на суд (в арбитражный по МО). К позиции налоговой (что нарушение длящееся) судья отнеслась скептически, уверенно решила в мою пользу. Спасибо sam_79 за помощь.
Итого - по мне, так лучше бы увеличили срок с 3 дней до пары месяцев, спокойно можно было бы уведомлять. А так - уведомишь в трехдневный срок, чего-нибудь упустишь, не успеешь, и дальше штрафовать тебя или нет, зависит от настроения налоговой (не думаю впрочем что оно бывает таким уж плохим). В моем случае я первый раз уведомил спустя пол года по почте, и заявление завернули - не было нотариально заверенной копии. Исправил, отправил еще раз, приняли, и выписали штраф.