Мы выполняем комплекс работ для заказчика, которые подпадают под статью 149, п.3, пп.16 НК, а именно
Освобождается от НДС..... выполнение научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ за счет средств бюджетов, а также средств Российского фонда фундаментальных исследований, Российского фонда технологического развития и образуемых для этих целей в соответствии с законодательством Российской Федерации внебюджетных фондов министерств, ведомств, ассоциаций; выполнение научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ учреждениями образования и научными организациями на основе хозяйственных договоров.
Вопрос в том, что средства бюджета выделяются Заказчику, а не нам. А мы юр.лицо, ООО, находящееся на общей системе налогообложения. Заказчик требует счет-фактуру без НДС. А меня гложат сомнения. Помогите разрулить ситуацию. Спасибо.