Kriss-Tina, вы уже потратили средства целевого финансирования на покупку лицензии ПО. Их Вы и отражаете по 86 счету. Для чего тут может использоваться 97 счет, непонятно.
Используя его Вы будете иметь недостоверные данные по 86 счету. Т.е. видать остатки целевого финансирования, а по факту оно уже потрачено