Все равно налоговая будет пытаться снять налог. Уж больно лакомый кусочек при такой цене.
А Минфин вообще считает, что раз использовалось в предпринимательской деятельности, то все, никаких имущественных вычетов, даже после закрытия ИП. Это бред, конечно, но руководствоваться налоговые скорее всего будут именно этим мнением
Так что суд опять будет у Вас практически наверняка. И с учетом того, что Вы уже будете не ИП, судиться придется в СОЮ. А они налоговое законодательство знают плохо и потому результат непредсказуем