Как и любым другим сотрудникам вашей организации (если у них не остались ТК советского образца)
Пожалуй, что нет. Так как часть платежей, сделанных ИГ в 2015 году относятся к следующему налоговому периоду. Скорее всего их можно будет зачесть в следующем году. Ждём разъяснения на этот счёт.
Те, которые по патенту - да.
Заявление в налоговую пишется один раз.