В Бухгалтерии 3.0 способ расчета страховых взносов при расчете зарплаты в программе Бухгалтерия 3.9 устанавливается в меню "сотрудники и зарплата" в панели навигации в разделе "справочники и настройки" пункт "Настройки учета зарплаты" на закладке "Налоги и взносы с ФОТ"